systems biology पेपर

Multi-Omics Mapping of Human Kidney Reveals Complement-Mediated Cellular Dynamics During Progression of Focal Segmental Glomerulosclerosis

मानव किडनी बायोप्सी पर मल्टी-ओमिक्स दृष्टिकोणों को एकीकृत करके, यह अध्ययन स्पष्ट करता है कि कैसे पोडोसाइट्स और पैरीटल एपिथेलियल कोशिकाओं में पूरक-मध्यस्थता (complement-mediated) संबंधी अनियमितता फोकल सेगमेंटल ग्लोमेरुलोस्केलेरोसिस में ग्लोमेरुलर इंजरी और फाइब्रोसिस को संचालित करती है, जो चरण-विशिष्ट हस्तक्षेपों के लिए संभावित लक्ष्यों को प्रकट करती है।

Hayashi, S., Takeuchi, M., Nakano, T., Setoyama, D., Singh, S. A., Sonawane, A. R., Iwamoto, T., Kishimoto, H., Tsuchimo (…)2026-02-20

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A versatile method to pattern surfaces within microfluidic devices

यह शोधपत्र व्यावसायिक रूप से उपलब्ध अभिकर्मकों का उपयोग करते हुए विविध बायोमॉलिक्यूल्स के साथ सीलबंद माइक्रोफ्लुइडिक उपकरणों को पैटर्न करने के लिए एक बहुमुखी फोटोलिथोग्राफिक विधि प्रस्तुत करता है, जो इन सीटू (in situ) सतह संशोधन को सक्षम बनाता है और लक्ष्य कैप्चर तथा जीन एक्सप्रेशन के लिए क्रमशः सहसंयोजक (covalent) बनाम गैर-सहसंयोजक (noncovalent) डीएनए बाइंडिंग के विशिष्ट लाभों को प्रदर्शित करता है।

Collins, K., Stanley, C. E., Ouldridge, T. E.2026-02-20

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Modeling and Tracking of Heterogeneous Cell Populations via Open Multi-Agent Systems

यह शोध पत्र एक उन्नत सेल-ट्रैकिंग एल्गोरिदम प्रस्तुत करता है जो ओपन मल्टी-एजेंट सिस्टम और एक एक्सटेंडेड कलमान फ़िल्टर का उपयोग करता है ताकि को-कल्चर माइक्रोस्कोपी वीडियो में ऑस्टियोसारकोमा और मेसेनकाइमल स्ट्रोमल कोशिकाओं जैसी विषम सेल आबादी की जटिल गतिशीलता, अंतःक्रियाओं और वंशावली को मॉडल, पैरामीटराइज और पूर्वानुमानित किया जा सके।

Tramaloni, A., Testa, A., Avnet, S., Massari, S., Di Pompo, G., Baldini, N., Notarstefano, G.2026-02-18

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Spatial Rewiring of Enterocyte Identity in Celiac Disease

स्थानिक और एकल-कोशिका ट्रांसक्रिप्टोमिक्स को एकीकृत करके, यह अध्ययन प्रकट करता है कि सीलिएक रोग (celiac disease) BMP- और WNT-उत्पादक मेसेनकाइमल कोशिकाओं के बीच की दूरी को छोटा करके सामान्य क्रिप्ट-विलस संगठन को बाधित करता है, जिससे एंटरोसाइट्स एक नई, असामान्य पहचान प्राप्त कर लेते हैं जो ओवरलैपिंग ज़ोनल प्रोग्राम और गैस्ट्रिक मेटाप्लासिया द्वारा चिह्नित होती है।

Barkai, T., Frieman-Sharabi, R., Bahar Halpern, K., Novoselsky, R., Korem Kohanim, Y., Shir, S., Golani, O., Goliand, I. (…)2026-02-17

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Agent-Based Model Replication of Global Treadmilling and Competition in the Actin Polymerization System

यह शोध पत्र एक नेटलोगो-आधारित एजेंट-आधारित मॉडल प्रस्तुत करता है जो एक्टिन पॉलीमराइजेशन के प्रमुख चरणों, जिसमें वैश्विक ट्रेडमिलिंग और न्यूक्लिएशन एवं एलोंगेशन के बीच की प्रतिस्पर्धा शामिल है, को सफलतापूर्वक दोहराता है, जो पैरामीटर हेरफेर के माध्यम से जटिल आणविक तंत्रों को सिम्युलेट करने के एक उपकरण के रूप में इसकी उपयोगिता को प्रदर्शित करता है।

Tarantino, R., Contino, S., Gugliotta, L., Indelicato, G., Panunzi, G., Bertolazzi, G., Romano, V.2026-02-16

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Cell cycle-dependent protein dynamics in budding yeast resolved by deconvolution of bulk proteomics

लेखकों ने बल्क प्रोटिओमिक्स और अपूर्ण सेल सिंक्रोनाइज़ेशन की सीमाओं को दूर करने के लिए एक जनसंख्या मॉडल के साथ मिलकर एक कम्प्यूटेशनल डीकनवोल्यूशन विधि विकसित की, जिससे बडिंग यीस्ट में 563 प्रोटीनों के लिए सेल चक्र-निर्भर प्रोटीन गतिकी को सफलतापूर्वक हल किया गया और सेल चक्र चरणों के दौरान महत्वपूर्ण चयापचय विविधताओं का खुलासा हुआ।

Zylstra, A. J., Rovetta, M., Vedelaar, S., Bleischwitz, C., Fülleborn, J. A., van Oppen, Y. B., Markus, H. P., Korbeld (…)2026-02-13

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Emergent Threshold Dynamics in Unified Metabolic-Regulatory Models: Achieving Spontaneous Homeostasis Through Bidirectional ATP-Pathway Coupling

यह शोध पत्र सिग्नल हियरार्किकल पेट्री नेट्स (Signal Hierarchical Petri Nets) को प्रस्तुत करता है, जो एक नवीन कम्प्यूटेशनल औपचारिकता है जो चयापचय अवस्था (ATP स्तरों) को नियामक नियंत्रण के साथ द्विदिश रूप से युग्मित करके उद्गामी थ्रेशोल्ड गतिकी (emergent threshold dynamics) और स्वतःस्फूर्त होमियोस्टैसिस प्राप्त करती है, जिससे स्पष्ट प्रोग्रामिंग के बिना पाथवे स्विचिंग और ऊतक-विशिष्ट ड्रग संचय जैसे अनुकूलनशील कोशिकीय व्यवहारों का इन सिलिको पुनरुत्पादन संभव होता है।

Simao, E.2026-02-09

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Hierarchical organization in sparse gene regulatory networks shapes structural coherence and emergent regulatory coordination

यह शोध पत्र एक टोपोलॉजी-आधारित कोहेरेंस मैट्रिक्स (coherence matrix) प्रस्तुत करता है यह प्रदर्शित करने के लिए कि पदानुक्रमित संगठन, विशेष रूप से एक सघन फीडबैक-समृद्ध मध्य परत, विरल जीन नियामक नेटवर्क (sparse gene regulatory networks) को विभिन्न विरलता स्तरों के बीच संरचनात्मक सुसंगतता बनाए रखकर मजबूत वैश्विक नियामक समन्वय प्राप्त करने में सक्षम बनाता है।

Harlapur, P., Jagadeesan, R., Ribeiro, A. S., Kadelka, C., Jolly, M. K.2026-02-05

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Activities of aqueous extract of Tamarindus indica on phenylhydrazine-induced hematopathological changes in anemic male wistar rats

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि *Tamarindus indica* फल के गूदे का जलीय अर्क, RBC (लाल रक्त कोशिका) रूपात्मक विकृतियों, बढ़े हुए सीरम LDH, और अस्थि मज्जा (बोन मैरो) के क्षय सहित हेमेटोपैथोलॉजिकल परिवर्तनों को उलटकर, नर विस्टार चूहों में फिनाइलहाइड्राज़ीन-प्रेरित हेमोलिटिक एनीमिया को प्रभावी ढंग से सुधारता है और हेमेटोपोएसिस को उत्तेजित करता है।

Dare, S. S., Stephen, C. P., Mario, E. F.2026-02-02

📄 systems biology

FLARE: Fine-grained Learning for Alignment of spectra-molecule REpresentation Enhances Metabolite Annotation

FLARE एक नवीन कंट्रास्टिव लर्निंग फ्रेमवर्क है जो सूक्ष्म स्पेक्ट्रल-स्ट्रक्चरल संबंधों को पकड़ने के लिए द्विदिश पीक-नोड संरेखण (bidirectional peak-node alignment) का लाभ उठाकर मेटाबोलाइट एनोटेशन को बढ़ाता है, जिससे अत्याधुनिक प्रदर्शन प्राप्त होता है और कैंसर अनुसंधान में महत्वपूर्ण ट्रांसलेशनल क्षमता प्रदर्शित होती है।

Zhou Chen, Y., Rushing, B. R., Hassoun, S.2026-01-28

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